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[期刊]云计算在高通量测序数据分析中的应用

[日期:2014-05-23] 来源:CNKI   作者:崔振 [字体: ]

云计算在高通量测序数据分析中的应用

崔振

高通量测序技术在DNA测序发展历程中具有里程碑的意义。本文首先介绍了高通量测序及其主要应用。高通量测序应用广泛,产生的数据具有数据量大,序列短等特点。单纯通过改进算法已经不能满足用户对数据处理速度的要求。高性能并行计算服务器通常用来进行高通量测序数据分析,然而这些服务器价格昂贵,维护成本高,对有些研究机构来说并不是最好的选择。而云计算具有低成本、高自动性、高灵活性等特点,可作为高通量数据分析的一种解决方案。用户在进行数据分析时,选择相应的程序部署到云平台上。该类程序通常需要实现MapReduce计算模型。随后本文介绍了几款利用云平台进行高通量分析的应用程序,包括它们的主要功能,采用的算法思想,优缺点。为选择和使用和该类软件提供指导。


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