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公有云中基于系统工作流的并行策略性能评估

[日期:2014-12-16] 来源:中国科技论文   作者:潘佰林 李淑萍 汪炎平 龙丹 [字体: ]

公有云中基于系统工作流的并行策略性能评估

潘佰林 李淑萍 汪炎平 龙丹

分析系统发育基因组工作流程并行处理性能,提出了一种适用于云计算平台中SciPhylomics执行的性能评估工作流程。首先,介绍了映射化简模型的应用实现Hadoop;然后,呈现了SciCumulus云工作流程引擎;最后,在亚马逊EC2云上使用两种并行执行方法(SciCumulus和Hadoop)实施工作流程。实验结果表明,尽管系统发育基因组学实验对计算环境要求严格,但实验仍然适合在云中执行。此外,所评估的工作流程呈现出几组数据密集型工作流程的许多特征,本方法可以扩展到其他实验类型。


公有云中基于系统工作流的并行策略性能评估

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