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[PDF]基于Hadoop的大规模虚拟筛选数据的分析研究

[日期:2014-12-12] 来源:CNKI  作者:刘广才 [字体: ]

基于Hadoop的大规模虚拟筛选数据的分析研究

兰州大学  刘广才 

本文以H5N1禽流感病毒靶点为靶标、以ZINC数据库中小分子化合物为配体,开展了基于Hadoop的大规模虚拟筛选数据的分析研究。实现了化学开发工具包CDK对大规模数据的并行化操作,并结合RHadoop分布式数据分析平台,采用支持向量回归的方法实现了虚拟筛选中的化合物小分子数据和分子对接结果数据的统计分析。本文的主要工作为: 1)实现了化学开发工具包CDK对MapReduce编程框架的支持,并在此基础上搭建了CDK-Hadoop平台; 2)基于CDK-Hadoop平台,完成了ZINC数据库中小分子化合物属性解析的工作; 3)基于RHadoop平台,采用支持向量回归的数据分析方法,对大规模虚拟筛选数据进行了统计分析。


基于Hadoop的大规模虚拟筛选数据的分析研究

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